Implementacija EU projekata neizostavno je područje djelovanja Istarske razvojne agencije. Tijekom proteklih godina IDA je ostvarila vrlo dobru suradnju s raznim institucijama i razvojnim agencijama u zemlji i inozemstvu te je kroz višegodišnju suradnju realizirano 60 značajnih projekata ukupne vrijednosti više od 87 milijuna eura, od čega je za IDA-u odobreno 11 milijuna eura.
Najveći projekti IDA-e, ostvareni uz pomoć EU sredstava, jesu uspostava Centra za istraživanje materijala Istarske županije METRIS, projekt uspostave Tehnološkog inkubatora Pula te projekt izgradnje Poduzetničkog centra Coworking Pula. Trenutno je 6 aktualnih projekata u provedbi ukupne vrijednosti 15 milijuna eura. Projekti se provode u sklopu programa prekogranične suradnje Italija-Hrvatska, Erasmus te putem funanciranja iz ESI fondova.
